Detection of Microorganisms in Clinical Sonicated Orthopedic Devices Using Conventional Culture and qPCR / Detecção de microrganismos em dispositivos ortopédicos sonicados clínicos usando cultura convencional e qPCR

Abstract Objective To evaluate the sensitivity and specificity of the quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) for 16S rDNA gene screening using sonicated fluid from orthopedic implants. Methods A retrospective study was conducted on 73 sonicated fluids obtained from patients with infection associated with orthopedic implants. The samples were subjected to conventional culture and molecular testing using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and qPCR for 16S rDNA. The cycle threshold values were used to define a cut-off of the qPCR of the 16S rDNA for negative and positive cultures. Results No statistical differences were observed between the positive and negative culture groups based on the time from the first surgery to infection (p= 0.958), age (p =0.269), or general comorbidities. Nevertheless, a statistical difference was found between the mean duration of antibiotic use before device removal (3.41 versus 0.94; p =0.016). Bacterial DNA was identified in every sample from the sonicated fluids. The median cycle thresholds of the positive and negative cultures were of 25.6 and 27.3 respectively (p< 0.001). As a diagnostic tool, a cycle threshold cut-off of 26.89 demonstrated an area under the curve of the receiver operating characteristic of 0.877 (p≤ 0.001). Conclusion The presence of antimicrobial agents for more than 72 hours decreased culture positivity, but did not influence the qPCR results. Despite this, amplification of the 16S rDNA may overestimate infection diagnosis.

Resumo Objetivo Avaliar a sensibilidade e a especificidade da reação em cadeia de polimerase em tempo real quantitativa (quantitative real-time polymerase chain reaction, qPCR, em inglês) para a triagem do gene rDNA 16S, com a utilização do fluido sonicado de implantes ortopédicos. Métodos Um estudo retrospectivo foi realizado em 73 fluidos sonicados obtidos de pacientes com infecção associada aos implantes ortopédicos. As amostras foram submetidas a cultura convencional e a teste molecular utilizando ionização e dessorção a laser assistida por matriz com espectrometria de massa por tempo de voo (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS, em inglês) e qPCR para o gene rDNA 16S. Os valores limiares do ciclo foram usados para definir um ponto de corte para a qPCR do gene rDNA 16S para culturas negativas e positivas. Resultados Não foram observadas diferenças estatísticas entre os grupos de cultura positiva e negativa com base no tempo desde a primeira cirurgia até a infecção (p= 0,958), na idade (p= 0,269), ou nas comorbidades em geral. No entanto, uma diferença estatística foi encontrada entre a duração média do uso de antibióticos antes da remoção do dispositivo (3,41 versus 0,94; p= 0,016). O DNA bacteriano foi identificado em todas as amostras dos fluidos sonicados. Os limiares do ciclo médio de culturas positivas e negativas foram de 25,6 e 27,3, respectivamente (p< 0,001). Como uma ferramenta de diagnóstico, um corte do limite do ciclo de 26,89 demonstrou uma área sob a curva da característica de operação do receptor de 0,877 (p ≤ 0,001). Conclusão A presença de agentes antimicrobianos por mais de 72 horas diminuiu a positividade da cultura, mas não influenciou os resultados da qPCR. Apesar disso, a amplificação do rDNA 16S pode sobrestimar o diagnóstico de infecção.

Avaliação nutricional e metabólica após bypass gástrico em Y-de-Roux há mais de dois anos / Nutritional and metabolic evaluation after two years Roux-en-Y gastric bypass

Objetivo: Descrever a influência da cirurgia bariátrica por bypass gástrico em Y-de-Roux no estado nutricional e metabólico e comparar com resultados de outras pesquisas. Métodos: 214 prontuários foram analisados retrospectivamente - os dados contemplaram pacientes submetidos a cirurgia bariátrica bypass gástrico em Y-de-Roux com tempo de pós-operatório entre 2 e 4 anos. Os parâmetros laboratoriais coletados foram hemoglobina, ferritina, ácido fólico, TSH, albumina, PTH, vitamina B12, vitamina D e zinco. Comparou-se os períodos pré e pós-operatório através de média ± desvio-padrão, determinando se tais parâmetros estavam adequados ou deficitários, de acordo com seus valores de referência. Foi considerado um nível de significância de p < 0,05. Resultados: Verificou-se aumento da média no período pós-operatório dos parâmetros de albumina (4,26 para 4,37; p <0,001), PTH (44,6 para 49,8; p = 0,101), vitamina B12 (427 para 537; p = 0,128) e vitamina D (23,3 para 27,6; p = 0,012). Por outro lado, os valores médios que reduziram foram hemoglobina (13,8 para 12,9; p < 0,001), ferritina (165 para 68,9; p < 0,001), ácido fólico (12,4 para 12,2; p = 0,540), TSH (2,53 para 2,24; p < 0,001) e zinco (98,5 para 93,1; p = 0,016). Conclusões: Houve piora nos parâmetros de hemoglobina, ferritina e zinco, enquanto os valores de TSH, albumina e vitamina D melhoraram quando comparados às médias de pré-operatório (vitamina B12, ácido fólico e PTH não apresentam relevância estatística). O acompanhamento médico torna-se fundamental no diagnóstico e correção de possíveis deficiências metabólicas e nutricionais relacionadas a cirurgia

Objective: Describe the influence of bariatric surgery by Y-en-Roux gastric bypass on the metabolic and nutritional status, including the comparison with results from previous studies. Methods: 214 records were analyzed retrospectively - the data analysis covered patients between 2 to 4 years after Y-en-Roux gastric bypass surgery. The laboratorial parameters collected were hemoglobin, ferritin, folic acid, TSH, albumin, PTH, vitamin B12, vitamin D and zinc. Pre and post-operative were compared through mean parameters ± standard deviation, determining if these were appropriated or deficient, according references. Results was considered significant if p < 0,5. Results: It was verified an increase of the mean parameters in the post-operative for albumin (4,26 to 4,37; p < 0,001), PTH (44,6 to 49,8; p = 0,101), vitamin B12 (427 to 537; p = 0,128) and vitamin D (23,3 to 27,6; p = 0,012). Otherwise, a reduction was seen in hemoglobin (13,8 to 12,9; p < 0,001), ferritin (165 to 68,9; p < 0,001), folic acid (12,4 to 12,2; p = 0,540), TSH (2,53 to 2,54; p < 0,001) and zinc (98,5 to 93,1; p = 0,016). Conclusion: It was found that the parameters of hemoglobin, ferritin and zinc decreased, while TSH, albumin and vitamin D improved when compared to the pre-operative average values (vitamin B12, folic acid and PTH revealed no statistical relevance). The follow up has become critical in diagnosing and correcting possible nutritional and metabolic deficiencies due to surgery